Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Nicotiana tabacum var. TN90) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Nicotiana tabacum

CDS Sequence

CDS ID	lcl\|NW_015828433.1_cds_XP_016503408.1_16955
CDS Infomation	[gene=LOC107821487] [db_xref=GeneID:107821487] [protein=probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK] [protein_id=XP_016503408.1] [location=join(2775..4237,4768..6223)] [gbkey=CDS]
Sequence	ATGAGGAAGGTAATTGCTACGGTAATATTTTTGTGTATTTTATGTCCCATTTTTGTTAAA GCACTGAACCTATCTTTCAATGATGATATACTGGGGTTAATGGTATTCAAGGCTGACATT CAAGATCCACTAGGAAATTTAGTGTCTTGGAATGAAGAAGATGATAGCCCATGTAACTGG AATGGGATCAAATGCAACCCAAGATCCAATAGGGTCTCTCAAATTGTTCTTGATGGTTTT GGTCTTTCAGGGAAGATTAGCAGAGGTCTTTTGAGGTTACAGCTTCTTCGAAAGCTTTCG CTTGCGAAGAACAATTTTACAGGGAGTATAAGTTCCACTGTTGTTCAGCTTGATAATCTG AGGGTGCTTGACTTGAGTGAGAACAACTTTTTCGGGCTGATCCCGGGTGATTTCTTTCGA CAATGTGGGCCTTTGAGGTCAGTTTCATTGGCCAAGAATAAGTTTTTAGGGAAGATTCCA GGAAGTTTGAGCTCATGTGTGGCACTGGGGTCTTTAAACTTGTCGTCCAATCAGTTTTCA GGATTGTTACCCTCTGGAATTTGGTCTTTGAATGGCTTAAGGTCACTTGATCTGTCAGAT AATTTGCTGGATGGTGAAATTCCAGTAGGGATTGAAGGTATGTATAATTTGAGAGCCATA AATTTGAGGAAAAATCGACTCACTGGCGAATTTCCTGATGGGATTGGGAGTTATTTGCTT TTGAGGTCAATTGATTTGAGTGAAAATTCTCTCTCTGGAGAACTTCCAGAAACAATGCAG ATGCTTAGCTTGTGTAATGAATTGATCTTGAAAAACAATGCATTTGTCGGTACTGTACCA GAATGGGTTGGAGAAATGAAAAGCCTTGAAATACTTGATCTTTCTATGAACAACTTCTCT GGTCAGTTCCCGACTTCAATTGGGAAGCTTCAATCATTGAAATTATTAAATGTGTCGCAA AATGCTATTTCTGGAAACTTGCCCGAGTCCATGAGCAATTGTGTTAATCTTATGACTTTG GATGTTAGTCATAACACTTTGACGGGTGGTCTTCCTCCTTGGGTATTCAAAGTAGGATTG CGACAAGTTTTGTTTTCCGAGAATAAGTTAACTGGGGGCTTAAAGAATGCTTTTGCTTCA TCGCTAGACAACTCTCGCCAAAAGCTTCTAGCTCTCGATATCTCTTGCAATGAGTTATCT GGCGAAATTCCATTTGCTATTGGAGATTTTAATAGCTTGCGGTCCTTCAATATATCCAGA AATTCACTTGTAGGCGCCATTCCTCACACTGTTGGCCTACTGAAGTCACTGAATGTTCTT GACTTAAGTGAAAATCGGTTAAATGGTAGTATCCCTTTGGAACTTGGAGGAGCCTATTCT CTCAGGGAACTGAAGCTGGAGAATAACGCCTTGACGGGAGAAATTCCTAGTTCTATTGGA AACTGTTCAACACTGGTGTCCATGTCTCTATCACATAATGGTTTAACTGGCCCTGTACCT GCAACCCTAGCTAAACTAACTTACCTTCAAAATGTTGACCTATCCTTTAACAAATTAACC GGAATCTTACCAAAGCAGCTTGTAAATCTTGGTCACCTCTTATCGTTCAACATCTCATAC AACCAGCTAAAGGGCGAACTGCCTTCTGGTGGTCTTTTTAACACTATTTCTCCTTATTCT GTGTCAGCCAATCCGTCTCTTTGTGGGGCTGCTGTTAATAGGTCTTGTCCTACTGTCCTT CCCAAGCCGATTGTTCTGAACCCCAACTCCACAGAGTCTATTCCTGGTACTATCCCTCCA ACTTTTGGCCATGAGAAAAAAATCTTAAGCATCTCTGCCCTCATTGCCATTAGTGCAGCT GCTGTTATTGTTGTTGGTGTTATTGCCATTACTGTGCTCAATCTTCGTGTACGGGCTGCT ACATCTCGCTCTACTGCTGCCCTTACATTTTCTGGTGGAGATGACTTTAGTGGCTCACGC AGTACAGATGCAAATTCTGGTAAGCTTGTCATGTTTTCAGGCGAACTTGACTTCAGCACA GGGTCACATGCTCTGCTTAACAAGGATTGTGAGCTCGGACGTGGTGGTTTTGGAGCAGTT TATCGCACTGTCCTCGCAGATGGGATGCCAGTGGCCATTAAGAAGCTTACCGTCTCCGGT CTTGTTAAGTCTCAACAAGACTTCGAAAAGGAGGTTAAGAAATTGGGAAAGATCCGTCAC CCTAATCTTGTGGCCCTTCAAGGTTATTATTGGACACCTTCCCTACAGCTACTTATATAT GAATTTGTAGCTGGTGGAAATTTGTATGAGCATATCCATGAAAGTTCTAGTGGAAATTTA CTCTCGTGGAATGAGCGGTTCAACGTTATTCTTGGGACAGCAAAAGGCTTGGCTAACTTG CATCGAATGAACATAATTCATTACAACCTAAAGTCCAGCAATATTTTGATTGATAGCTCC GGTGATCCTAAAGTTGCGGATTATGGGTTAGCAAGGTTATTACCAATGTTAGATCGATAT GTCTTGAGCAGCAAAATTCAAAGTGCACTTGGTTACATGGCACCAGAATTCGCATGCAAG ACTGTGAAGATAACTGAGAAGTGTGATGTGTATGGGTTTGGAGTTCTTGTTCTGGAGGTA GTCACGGGAAAGAAGCCAGTCGAGTACATGGAGGACGATGTTATGGTATTGTGTGACATA GTGAGGGGAGCATTAGAAGATGGCAAGGTTGAAGAATGTGTTGACGGGAGGCTGCATGGA AAATTTCCAGTGGAGGAGGCGATTCCTGTAATGAAGTTGGGTTTAATCTGCACATCACAA GTCCCGTCTAACCGGCCTGATATGGCAGAAGTGGTTAACATTTTGGAAATGATCAGATGT CCTTCAGAAGGCCAGGATGAACCTCATCAGACATTGTAA

Peptide Sequence

PEP ID	XP_016503408.1
PEP Infomation	PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK [Nicotiana tabacum]
Sequence	MRKVIATVIFLCILCPIFVKALNLSFNDDILGLMVFKADIQDPLGNLVSWNEEDDSPCNW NGIKCNPRSNRVSQIVLDGFGLSGKISRGLLRLQLLRKLSLAKNNFTGSISSTVVQLDNL RVLDLSENNFFGLIPGDFFRQCGPLRSVSLAKNKFLGKIPGSLSSCVALGSLNLSSNQFS GLLPSGIWSLNGLRSLDLSDNLLDGEIPVGIEGMYNLRAINLRKNRLTGEFPDGIGSYLL LRSIDLSENSLSGELPETMQMLSLCNELILKNNAFVGTVPEWVGEMKSLEILDLSMNNFS GQFPTSIGKLQSLKLLNVSQNAISGNLPESMSNCVNLMTLDVSHNTLTGGLPPWVFKVGL RQVLFSENKLTGGLKNAFASSLDNSRQKLLALDISCNELSGEIPFAIGDFNSLRSFNISR NSLVGAIPHTVGLLKSLNVLDLSENRLNGSIPLELGGAYSLRELKLENNALTGEIPSSIG NCSTLVSMSLSHNGLTGPVPATLAKLTYLQNVDLSFNKLTGILPKQLVNLGHLLSFNISY NQLKGELPSGGLFNTISPYSVSANPSLCGAAVNRSCPTVLPKPIVLNPNSTESIPGTIPP TFGHEKKILSISALIAISAAAVIVVGVIAITVLNLRVRAATSRSTAALTFSGGDDFSGSR STDANSGKLVMFSGELDFSTGSHALLNKDCELGRGGFGAVYRTVLADGMPVAIKKLTVSG LVKSQQDFEKEVKKLGKIRHPNLVALQGYYWTPSLQLLIYEFVAGGNLYEHIHESSSGNL LSWNERFNVILGTAKGLANLHRMNIIHYNLKSSNILIDSSGDPKVADYGLARLLPMLDRY VLSSKIQSALGYMAPEFACKTVKITEKCDVYGFGVLVLEVVTGKKPVEYMEDDVMVLCDI VRGALEDGKVEECVDGRLHGKFPVEEAIPVMKLGLICTSQVPSNRPDMAEVVNILEMIRC PSEGQDEPHQTL

Transcript Sequence

Gene sequence data has not been registered.